Marka Farkı: Farklı yazıcı markalarından gelen mürekkep birbirinin yerine kullanılamaz. Örneğin, kanon yazıcılarının ve Epson yazıcılarının orijinal mürekkebi birbirinin yerine kullanılamaz çünkü doldurma bağlantı noktaları farklıdır ve hiç doldurulamaz. Bazı yerli mürekkepler için bile, üretim süreci iyileştirilmiş olsa da, farklı mürekkep markaları karıştırılamaz, aksi takdirde sedimantasyon, renk sapması ve diğer fenomenler meydana gelebilir.
Model Farkı: Aynı markanın yazıcıları için bile, farklı modellerin mürekkebi birbirinin yerine kullanılamaz. Buna ek olarak, evrensel mürekkep ve özel mürekkep arasındaki en büyük fark, uyumluluk ve performanslarında yatmaktadır. Özel mürekkep, iyi renk, pürüzsüzlük ve dayanıklılık ile belirli yazıcılar modelleri için özelleştirilmiştir; Evrensel mürekkep, belirli durumlarda renk sapması veya nozul tıkanma riski olabilir.
Mürekkep tiplerindeki farklılıklar: Farklı mürekkep türleri karıştırılamaz. Örneğin, boya mürekkebi ve pigment mürekkebi, UV mürekkebi ve ısı transfer mürekkebi karıştırılmamalıdır, aksi takdirde ciddi renk dökümü ve nozul tıkanmasına neden olur.